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钼同位素用于医疗应用，易司拓普先进材料可供应钼同位素，并可以各种化学形式提供。
天然存在的钼具有七个稳定同位素
| 同位素 | 最大可用富集（原子％） | 自然丰度（原子％） |
| ⁹²Mo | >99.9, <1 | 14.5 |
| ⁹⁴Mo | >99.9, <1 | 9.2 |
| ⁹⁵Mo | >99.9, <1 | 15.8 |
| ⁹⁶Mo | >99.9, <1 | 16.7 |
| ⁹⁷Mo | >99.9, <1 | 9.6 |
| ⁹⁸Mo | >99.9, <1 | 24.4 |
| ¹⁰⁰Mo | >99.9, <1 | 9.8 |
钼92（Mo 92）
Mo-92用于人类的营养研究。
钼94（Mo 94）
Mo-94用于人类的营养研究。
钼95（Mo 95）
Mo-95用于生产医用放射性同位素Ru-97。Mo-95还用于人类的营养研究。有人建议将耗尽的Mo-95用于UMo燃料元件中以进行高通量材料测试。
钼96（Mo 96）
Mo-96用于生产医用放射性同位素Tc-96和Tc-95m。Mo-95还用于人类的营养研究。
钼97（Mo 97）
Mo-97用于人类的营养研究。
钼98（Mo 98）
Mo-98用于生产Tc-99m。Tc-99m被认为是诊断核医学的“主力军”。Mo-98还用于人体营养研究。
钼100（Mo 100）
Mo-100还用于生产Tc-99m，这是医学诊断的主要工具。Mo-100还用于人类的营养研究。
